除了更多的衛星和信號外，還有一些其他的變化。與相鄰波段系統有關的干擾問題已經出現了。威脅，如干擾和欺騙，已經增加。GPS定位系統波形的頻率發生了變化，輸出也發生了變化。這種變化可能是正面的，也可能是負面的。

關于相鄰波段的問題，在美洲，相關的組織和單位使用部分L波段進行低功率的地面移動衛星服務，許多人說這將干擾GPS定位系統信號源。技術委員會已經完成了信息收集工作，但尚未發布其最終報告。人們仍然擔心，靠近基站的操作會對按照單頻標準建造的飛機的GPS定位系統信號產生不利影響。

自然或人為造成的GPS定位系統信號干擾或篡改也仍然是一個重大挑戰。這些威脅包括沖突行為和可能破壞空間系統的極端空間天氣事件，以及PNT惡意行為、計算機系統故障或簡單的通信故障。信息系統中出現的技術問題或者管理問題，都會造成嚴重的系統風險。

GPS定位系統的PNT備份也可能容易受到這些和其他威脅，包括容易受到物理攻擊的地面系統。所有這些都造成了目前看不見的潛在影響，但可能會對解決方案產生重大影響。。目前對這些干擾的研究還不夠成熟，需要更多的研究和更長的評價周期。

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